Новая жизнь казначейской системы в России началась в 1992 году после подписания Указа Президента «О Федеральном казначействе». В рамках исполнения этого Указа 14 июля 1993 года приказом Министерства финансов Российской Федерации создано Управление Федерального казначейства Министерства финансов Российской Федерации по Омской области (далее — Управление). Первым начальником назначен Пайор Владимир Александрович. 

Активный импульс в развитии Омское казначейство получило в 1994 году с момента назначения на должность Начальника Управления Геннадия Васильевича Бунькова. В феврале 1994 года образовываются отделения Управления в городах и районах Омской области. Кроме того, в том же году утверждаются структура и штатное расписание территориальных органов казначейства. По сути, этот год является годом становления функционала казначейской системы на территории Омской области. 

На сегодняшний день Омское казначейство возглавляет Галина Николаевна Сердюкова. Под ее руководством Управление Федерального казначейства по Омской области вошло в число лучших управлений Федерального казначейства по субъектам Российской Федерации. (omsk.roskazna.gov.ru)