Во время проведения археологических работ на городище Калос Лимен Западно-Крымской археологической экспедицией в 1994 году изучался строительный ярус I века до н. э. — первой половины II века н. э. Наряду с преобладающими сооружениями из камня на поселении встречены примитивные жилища — землянки, восходящие, видимо, к кочевому образу жизни. Они круглой формы, диаметром около 3,2–3,6 метров. В них обнаружено большое количество керамического материала.
Каменные жилища скифов II века до н. э. — I века н. э. построены на греческом культурном слое. Они чаще всего многокомнатные, иногда двухэтажные. Нижний ряд часто возводился в виде двух панцирей из плоских, поставленных на ребро больших камней с забутовкой из мелкого камня, а последующие — из камня средней величины на глиняном растворе. В хозяйственных помещениях по углам сделаны секторные или прямоугольные загородки из каменных плит. В I веке н. э. вся территория на месте руин одной из башен и вокруг нее оказалась сильно перестроенной. Над остатками помещений башни было возведено новое строение. Вдоль стен построек обнаружилось большое количество хозяйственных ям.
Большая численность ям, предназначавшихся для хранения наряду с другими продуктами запасов зерна, свидетельствует о важной роли хлебопашества в хозяйстве крымских скифов. Изучению подверглась яма 13, которая относится к последнему этапу существования позднескифского городища: около второй половины I — первой половины II н. э. Верхняя часть ямы уничтожена прямоугольным котлованом землянки. В связи с этим диаметр устья ямы не был установлен. Диаметр дна достигает 1,45–1,5 метра, глубина — 1,8 метра, форма колоколовидная.
