После Гражданской войны в Башкортостане сохранялась сложная экономическая обстановка. Непосредственно по территории Башкортостана долгое время проходил фронт Гражданской войны, с обеих сторон были отмечены массовые случаи мародёрства, грабежей и других преступлений против мирного населения. К примеру, по подсчётам правительственной комиссии только в трёх кантонах (Тамьян-Катайском, Бурзян-Тангаурском и Кипчак-Джетировском) пострадавшими оказались 100 тысяч дворов, были уничтожены 5377 хозяйств, до основания разрушено 2826 жилищ, 50 тысяч человек вообще не имело хлеба. Большая часть скота была реквизирована в годы войны или пала от бескормицы в засушливом 1920 году. Национализация лесов в 1918 году лишило возможности также заниматься традиционными кустарными лесными промыслами. Были разрушены производительные силы сельского хозяйства.
В 1918–1920 годах происходила продразвёрстка и бесчинства продотрядов, которая из Башкортостана по существу выкачала все продовольственные ресурсы, особенно из районов с преимущественным проживанием башкирского населения, объявленного «контрреволюционным». Летом 1920 года к власти в Башкирской республике пришли некомпетентные в местных вопросах люди из других окраин страны, которые решили произвести продразвёрстку любой ценой, забирали весь урожай и даже семена. К началу февраля 1921 года было реквизировано на территории Уфимской губернии — 13 млн пудов зерна и фуража, 12 тыс. пудов сливочного масла, 12 млн шт. яиц; на территории «Малой Башкирии» — 2,2 млн пудов зерна, 6,2 тыс. пудов сливочного масла, 39 тыс. голов крупного и 82 тыс. голов мелкого рогатого скота, 2,2 тыс. пудов мёда.
Подавление повстанческого движения 1918–1921 гг. (в том числе Бурзян-Тангауровского, Бураевского и Вилочного восстаний), сопровождалось широкомасштабным террором, грабежами, конфискациями имущества, изыманием продовольствия у башкирского населения.
Помимо сильной разрухи на республику в 1921–1922 годах обрушился голод, унесший жизни 22% населения, эпидемии холеры и тифа. В 1921 году в Поволжье разразилась засуха, средняя урожайность зерновых культур сократилась до 2,1 пуда с десятины. Несмотря на это в 1921 году из Уфимской губернии было вывезено по железной дороге 685,3 тысячи пудов хлеба, а в 1922 году — свыше 1,5 миллиона пудов и примерно столько же водным путём. Все это осложняло процесс восстановления народного хозяйства. Лишь 1922–1923 годы стали более-менее удачными и явились отправной точкой для подъема экономики Башкортостана.
